RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.85□□□□□ -0.99
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PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 C16orf90A8MZG2 172 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 COX7A2LO14548 114 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 SERF1AO75920 110 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP161Q6P656 301 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.84□□□□□ -0.99
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PGGT1B-204ENST00000503638 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.73□□□□□ -1.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PGGT1B-204ENST00000503638 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.72□□□□□ -1.01
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PGGT1B-204ENST00000503638 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 F8VRH5 84 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFA1O15239 70 aa8.67□□□□□ -1.02
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