RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFA1O15239 70 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV2D-28P01615 120 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 MED14OSP0DP75 135 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 Q6ZTI0 123 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 Q8N6K4 173 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 FLNCQ14315 2725 aa6.14□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 LECT2O14960 151 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFC2O95298 119 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3-11P01762 117 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 GNLYP22749 145 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.13□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 KLLNB2CW77 178 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 PSMB8P28062 276 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 F8WEM9 126 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 TIMM17BO60830 172 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 ZANQ9Y493 2812 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 ODF3BA8MYP8 253 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 M0R2N4 97 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.12□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.11□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.11□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.11□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 CCKP06307 115 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 Q96MF0 132 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.1□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.09□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.09□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.09□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 C19orf84I3L1E1 186 aa6.09□□□□□ -1.43
VWA3B-220ENST00000495571 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.08□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.08□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.08□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.07□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.07□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 A0A087WZ39 114 aa6.07□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 MAST4O15021 2626 aa6.07□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 CRPP02741 224 aa6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.05□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.05□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 TENM4Q6N022 2769 aa6.05□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PRX2 142 aa6.05□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 SCXQ7RTU7 201 aa6.05□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.04□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.04□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 CCL18P55774 89 aa6.04□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 CFHR3Q02985 330 aa6.04□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 KLKP1Q107X0 134 aa6.04□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PPR1 153 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 A8MU10 97 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 LRRK2Q5S007 2527 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 A0A096LNT2 108 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 PTPN13Q12923 2485 aa6.03□□□□□ -1.44
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 SAA4P35542 130 aa6.02□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 HAMPP81172 84 aa6.01□□□□□ -1.45
VWA3B-220ENST00000495571 LINC00158P58513 81 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms