RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 A0A096LPF7 62 aa11.7□□□□□ -0.54
TOM1-216ENST00000492723 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.7□□□□□ -0.54
TOM1-216ENST00000492723 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.7□□□□□ -0.54
TOM1-216ENST00000492723 CELA1Q9UNI1 258 aa11.7□□□□□ -0.54
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TOM1-216ENST00000492723 CFC1P0CG37 223 aa11.69□□□□□ -0.54
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TOM1-216ENST00000492723 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.69□□□□□ -0.54
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TOM1-216ENST00000492723 SS18Q15532 418 aa11.55□□□□□ -0.56
TOM1-216ENST00000492723 MTURNQ8N3F0 131 aa11.55□□□□□ -0.56
TOM1-216ENST00000492723 COL6A5A8TX70 2615 aa11.55□□□□□ -0.56
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TOM1-216ENST00000492723 Q1RN00 199 aa11.55□□□□□ -0.56
TOM1-216ENST00000492723 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.54□□□□□ -0.56
TOM1-216ENST00000492723 F8W1H4 67 aa11.54□□□□□ -0.56
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TOM1-216ENST00000492723 Q8N3U1 123 aa11.54□□□□□ -0.56
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TOM1-216ENST00000492723 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TOM1-216ENST00000492723 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.47□□□□□ -0.57
TOM1-216ENST00000492723 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.47□□□□□ -0.57
TOM1-216ENST00000492723 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TOM1-216ENST00000492723 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.47□□□□□ -0.57
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TOM1-216ENST00000492723 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
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