RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0J9YXV3	536 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		A6NDN8	102 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BRM9	83 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE4	Q13068	117 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE5	Q13069	117 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	BATF	Q16520	125 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	CEND1	Q8N111	149 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM243	Q9BU79	118 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	PRO0255	Q9UI72	69 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	VWF	P04275	2813 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0J9YY99	117 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		J3QQQ9	107 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	FXYD2	P54710	66 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	HERVK_113	P63121	156 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB135	Q30KP9	77 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	C3orf56	Q8N813	242 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1B0GUV1	79 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		H3BNG1	76 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMM17B	O60830	172 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB130B	P0DP73	79 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB130A	P0DP74	79 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	EMP1	P54849	157 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		Q6ZVH6	145 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0J9YXY3	114 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247		F5H768	121 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL25	O15444	150 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5G1	P05496	136 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	TCTA	P57738	103 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM101	Q96IK0	257 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	LITAF	Q99732	161 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2L6	O14933	153 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA1	O15239	70 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	DAD1	P61803	113 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247		K7EP13	123 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	COX6A2	Q02221	97 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf74	Q32Q52	190 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087WZ39	114 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0B4J2C4	111 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A1W2PPM0	123 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	SPINK8	P0C7L1	97 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	IFITM1	P13164	125 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	RBX1	P62877	108 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	GAGE6	Q13070	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4A-208	ENST00000489247	LELP1	Q5T871	98 aa		3.8	□□□□□ -1.8

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