RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488013.1

HDLBP-242, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-242ENST00000488013 IGLC3P0DOY3 106 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 ODF1Q14990 250 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 LINC01545Q5VT33 79 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 Q8N3U1 123 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.44□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 LCE6AA0A183 80 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.43□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 COX7A2LO14548 114 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 IGKCP01834 107 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 XCL1P47992 114 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 CFAP161Q6P656 301 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 A0A0J9YXV3 536 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 APOMO95445 188 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 SCGB1D1O95968 90 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 HERVK_113P61574 105 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 Q6ZR54 194 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 Q9HAA7 133 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 A0A087WZ39 114 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 MALP21145 153 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 C6orf223Q8N319 242 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-242ENST00000488013 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 C11orf86A6NJI1 115 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 PSCAO43653 123 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 TENM2Q9NT68 2774 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 FOXI1Q12951 378 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 M0R2N4 97 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 C14orf177Q52M58 125 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 SFTA2Q6UW10 78 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.37□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 F8WDY8 70 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 COX6A2Q02221 97 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 C5orf38Q86SI9 138 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.36□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 TMEM223A0PJW6 202 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.35□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 PRSS2P07478 247 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 SMIM6P0DI80 62 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 CXCL5P42830 114 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 S100A12P80511 92 aa7.34□□□□□ -1.23
HDLBP-242ENST00000488013 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 E9PLD3 99 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 PYY3Q5JQD4 70 aa7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LEPROTO15243 131 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 NMUP48645 174 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 Q8IZM0 81 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 VAMP8Q9BV40 100 aa7.32□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00587B1AMM8 73 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 USP17L23D6RBM5 183 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 SPINK8P0C7L1 97 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 CKS1BP61024 79 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 SPAG11BQ08648 103 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 STPG4Q8N801 248 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 COX7B2Q8TF08 81 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 C2orf48Q96LS8 159 aa7.31□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 ATOH7Q8N100 152 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.3□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 LYSTQ99698 3801 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 hDV102S1A0JD36 115 aa7.29□□□□□ -1.24
HDLBP-242ENST00000488013 J3QQQ9 107 aa7.29□□□□□ -1.24
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