RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.71□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 RYR3Q15413 4870 aa-0.71□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 ARHGEF5Q12774 1597 aa-0.71□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.72□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 MYOM1P52179 1685 aa-0.72□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 NAA60Q9H7X0 242 aa-0.72□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-0.72□□□□□ -2.52
PTEN-204ENST00000487939 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 LINC00470Q9BZP3 86 aa-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 MBD5Q9P267 1494 aa-0.73□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SFT2D2O95562 160 aa-0.74□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 CATR1Q13166 79 aa-0.74□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 DEFB123Q8N688 67 aa-0.74□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-0.74□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.74□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SCN7AQ01118 1682 aa-0.75□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.75□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 MT4P47944 62 aa-0.75□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.75□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 TET3O43151 1660 aa-0.75□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 Q56UQ5 140 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SPANXDQ9BXN6 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 LINC00474Q9P2X8 69 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 KIAA0556O60303 1618 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 NBASA2RRP1 2371 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.76□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 ITPR3Q14573 2671 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 CUL7Q14999 1698 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 TULP4Q9NRJ4 1543 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 M0R2T5 61 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SPINK4O60575 86 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 MGPP08493 103 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 SELENOWP63302 87 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.77□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 USH2AO75445 5202 aa-0.78□□□□□ -2.53
PTEN-204ENST00000487939 HMGXB3Q12766 1538 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SSSCA1O60232 199 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 APOC2P02655 101 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 IGLC1P0CG04 106 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 FAM223AQ8IWN6 122 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 FAM107BQ9H098 131 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.79□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 NAIPQ13075 1403 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 NDUFA2O43678 99 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 IFNGP01579 166 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SPRR2AP35326 72 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-0.8□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 BTG2P78543 158 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 LINC01600Q96MT4 127 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 TSC22D3Q99576 134 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.81□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-0.82□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 OOSP1A8MZH6 123 aa-0.82□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SPRR2EP22531 72 aa-0.82□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 SPRR4Q96PI1 79 aa-0.82□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.82□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 TOP2BQ02880 1626 aa-0.82□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 RYR1P21817 5038 aa-0.83□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 FGF7P21781 194 aa-0.83□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.83□□□□□ -2.54
PTEN-204ENST00000487939 LCN9Q8WX39 176 aa-0.83□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms