RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 PRM2P04554 102 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CARD19Q96LW7 228 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01587Q99440 93 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 LITAFQ99732 161 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 VWFP04275 2813 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFA1O15239 70 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 HERVK_113P63121 156 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 IL17DQ8TAD2 202 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2WQ96B02 151 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.85□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 H7C2G1 150 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 TRIAP1O43715 76 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS2P07478 247 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 NOTCH1P46531 2555 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 XGP55808 180 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 MUC4Q99102 2169 aa6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 SNCGO76070 127 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 MT-ATP8P03928 68 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 HTN1P15515 57 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-11P60412 298 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 Q6Q795 121 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 FAM104AQ969W3 186 aa6.84□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 GHRHP01286 108 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 HERV-K104P63124 156 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf82Q6UX34 121 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.83□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 A8MZ25 164 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 LST1O00453 97 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 H7C423 109 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 K7EQD1 137 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE2BQ13066 116 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE2EQ4V326 116 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZSN1 163 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 X6R8D5 127 aa6.8□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 ACYP1P07311 99 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf74Q96GX8 76 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM101Q96IK0 257 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 APOC4P55056 127 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1A-208ENST00000486964 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 COX7A2LO14548 114 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2L6O14933 153 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 Q9H8V8 135 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TRACP01848 142 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZTI0 123 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM243Q9BU79 118 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TTC32Q5I0X7 151 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms