RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-30P01768 117 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-33P01772 117 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 DDTP30046 118 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 NMUP48645 174 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 ENHOQ6UWT2 76 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 PCP2Q8IVA1 136 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 KLK12Q9UKR0 248 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 COL7A1Q02388 2944 aa7.33□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 SIVA1O15304 175 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.32□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 A0A087WZ39 114 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 J3QQQ9 107 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 K7EP13 123 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 SPINK8P0C7L1 97 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 MIAQ16674 131 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 CRPP02741 224 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.3□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 XCL1P47992 114 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 FOXI1Q12951 378 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 UBE2WQ96B02 151 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 Q9H8V8 135 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 HIGD1BQ9P298 99 aa7.29□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.28□□□□□ -1.24
OPTN-211ENST00000486862 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 ZNF815PA8K554 130 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 LINC00587B1AMM8 73 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 COX7A2LO14548 114 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 C5orf38Q86SI9 138 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 MUC7Q8TAX7 377 aa7.27□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 FBN3Q75N90 2809 aa7.26□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 NDUFA1O15239 70 aa7.25□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 CTAG1AP78358 180 aa7.25□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 COX7B2Q8TF08 81 aa7.25□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 KIAA0087Q14695 138 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 Q8IZM0 81 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.24□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 A0A0J9YXY3 114 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 APOMO95445 188 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 TAL2Q16559 108 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 SFTA2Q6UW10 78 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 RMI2Q96E14 147 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.23□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 TIMM17BO60830 172 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 MALP21145 153 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 HERV-K104P63124 156 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 HSD52Q0P140 79 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
OPTN-211ENST00000486862 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 C3orf84H3BNL1 204 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 CXCL5P42830 114 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 LITAFQ99732 161 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 COX11Q9Y6N1 276 aa7.21□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 M0R143 59 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 TTC32Q5I0X7 151 aa7.2□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 TMEM238C9JI98 176 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 PRSS2P07478 247 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 CASC10Q5T4H9 136 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZVH6 145 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 TM2D2Q9BX73 214 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 Q9HAA7 133 aa7.19□□□□□ -1.26
OPTN-211ENST00000486862 F8WDY8 70 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139 ms