RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		16	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	CST9L	Q9H4G1	147 aa		16	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		15.99	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	PMVK	Q15126	192 aa		15.99	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	COX7A2L	O14548	114 aa		15.98	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	SEC11A	P67812	179 aa		15.97	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		15.97	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	C15orf56	Q8N910	161 aa		15.97	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	PRSS1	P07477	247 aa		15.96	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	C5orf38	Q86SI9	138 aa		15.96	■□□□□ 0.15
KCNS3-205	ENST00000481414	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		15.95	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	COX6A2	Q02221	97 aa		15.95	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	MAL	P21145	153 aa		15.94	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		15.94	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	LEPROTL1	O95214	131 aa		15.93	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	HERVK_113	P63121	156 aa		15.93	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A087WZ39	114 aa		15.92	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A0J9YXV3	536 aa		15.92	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	hDV102S1	A0JD36	115 aa		15.92	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	PKHD1	P08F94	4074 aa		15.92	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	APOM	O95445	188 aa		15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	NDUFA6	P56556	154 aa		15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		15.91	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		15.9	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		15.9	■□□□□ 0.14
KCNS3-205	ENST00000481414	C16orf90	A8MZG2	172 aa		15.89	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		15.89	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		15.88	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		15.87	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLC3	P0DOY3	106 aa		15.87	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	15.87	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		15.86	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	FABP4	P15090	132 aa		15.86	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		15.86	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		15.86	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		15.85	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		15.84	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	SLPI	P03973	132 aa		15.84	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	GCSH	P23434	173 aa		15.84	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		15.84	■□□□□ 0.13
KCNS3-205	ENST00000481414	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		15.83	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		15.82	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		15.82	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	SPAG11B	Q08648	103 aa		15.81	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		15.81	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		15.81	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	C2orf48	Q96LS8	159 aa		15.8	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414		F8VRH5	84 aa		15.79	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		15.79	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	C11orf86	A6NJI1	115 aa		15.78	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414		H3BRM9	83 aa		15.78	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP10-1	P60331	282 aa		15.78	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	KIAA0087	Q14695	138 aa		15.78	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	ODF1	Q14990	250 aa		15.78	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414		F8WDY8	70 aa		15.77	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
KCNS3-205	ENST00000481414	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		15.76	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414		H0Y8G0	127 aa		15.76	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	SYCN	Q0VAF6	134 aa		15.76	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	LINC01620	Q4KN68	170 aa		15.75	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		15.75	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	S100A6	P06703	90 aa		15.74	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	CARD19	Q96LW7	228 aa		15.74	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	SPINK8	P0C7L1	97 aa		15.73	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414		Q8IZM0	81 aa		15.73	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		15.73	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		15.72	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		15.72	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	PRSS2	P07478	247 aa		15.71	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		15.71	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414		Q6ZRU5	148 aa		15.71	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		15.71	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		15.71	■□□□□ 0.11
KCNS3-205	ENST00000481414	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		15.7	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	NDUFA1	O15239	70 aa		15.7	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		15.7	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	PLN	P26678	52 aa		15.69	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	RNF151	Q2KHN1	245 aa		15.69	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	PET117	Q6UWS5	81 aa		15.69	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		15.69	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	DPM2	O94777	84 aa		15.68	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	C3orf79	P0CE67	100 aa		15.67	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	S100A2	P29034	98 aa		15.67	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		15.67	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	COX7B2	Q8TF08	81 aa		15.67	■□□□□ 0.1
KCNS3-205	ENST00000481414	TMEM223	A0PJW6	202 aa		15.66	■□□□□ 0.1

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