RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZN92 141 aa8.35□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 TMEM141Q96I45 108 aa8.34□□□□□ -1.07
HPS1-211ENST00000478087 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZUT4 128 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 C15orf56Q8N910 161 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 TOMM6Q96B49 74 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 TIMM17AQ99595 171 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.33□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 CHTF8P0CG12 524 aa8.32□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 S100A1P23297 94 aa8.32□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.32□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 IFITM10A6NMD0 228 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 J3QL48 77 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 LINC00614P0C842 121 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 ERASQ7Z444 233 aa8.31□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 IGIPA6NJ69 53 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 COLCA2A8K830 154 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 XCL1P47992 114 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 SEC11AP67812 179 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 FOXI1Q12951 378 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 VCX2Q9H322 139 aa8.3□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.29□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.29□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 AMELXQ99217 191 aa8.29□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 COX7A2LO14548 114 aa8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 APOMO95445 188 aa8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 HBDP02042 147 aa8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 TRGC2P03986 189 aa8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 FAM104AQ969W3 186 aa8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.28□□□□□ -1.08
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 MALP21145 153 aa8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 DPH3Q96FX2 82 aa8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.27□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 A0A087WYN8 130 aa8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 COX6A2Q02221 97 aa8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 BAGE3Q86Y29 109 aa8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.26□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 F8WDY8 70 aa8.25□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 ATP5LO75964 103 aa8.25□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 UBE2D1P51668 147 aa8.25□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 HSBP1O75506 76 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 HERVK_113P63121 156 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.24□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 SCO1O75880 301 aa8.23□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 PMVKQ15126 192 aa8.23□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.23□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 A0A087WZ39 114 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 A0A096LNJ9 63 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 ATP6V1G1O75348 118 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 C5orf38Q86SI9 138 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 C2orf48Q96LS8 159 aa8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HPS1-211ENST00000478087 MAJINQ3KP22 176 aa8.21□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 CST9LQ9H4G1 147 aa8.21□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.21□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 A0A096LNI7 61 aa8.2□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.2□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 OXTP01178 125 aa8.19□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 SPAG11BQ08648 103 aa8.19□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 SERF1AO75920 110 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 SYCNQ0VAF6 134 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 PMCHL1Q16048 86 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 STPG4Q8N801 248 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 CARD19Q96LW7 228 aa8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 H3BRM9 83 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 RNF151Q2KHN1 245 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.17□□□□□ -1.1
HPS1-211ENST00000478087 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.17□□□□□ -1.1
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