RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477633.1

PRDM15-211, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 2

Gene PRDM15, Length 466 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-211ENST00000477633 OXTP01178 125 aa7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 CRYBA4P53673 196 aa7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 ZNF876PQ49A33 203 aa7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.53□□□□□ -1.2
PRDM15-211ENST00000477633 A0A0B4J2C4 111 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-30P01768 117 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 CRYGDP07320 174 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 ID1P41134 155 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 KNCNA6PVL3 124 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 MGPP08493 103 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 EMP1P54849 157 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.51□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 A8MWV9 139 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 LEPROTO15243 131 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 TSHBP01222 138 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 AMTNQ6UX39 209 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 C9orf85Q96MD7 179 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 AMELXQ99217 191 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 CDIP1Q9H305 208 aa7.5□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 J3QQQ9 107 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 Q9H8V8 135 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.49□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 CCL18P55774 89 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 CKS1BP61024 79 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 Q6ZUT4 128 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 TMEM223A0PJW6 202 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 ZNF688P0C7X2 276 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 CFC1BP0CG36 223 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 CFC1P0CG37 223 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 PSMB2P49721 201 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 Q6ZQT7 251 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.47□□□□□ -1.21
PRDM15-211ENST00000477633 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.46□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TCL1BO95988 128 aa7.46□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.46□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.46□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 XCL2Q9UBD3 114 aa7.46□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 M0QY20 66 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 GNRH2O43555 120 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV3-33P01772 117 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SPINK8P0C7L1 97 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 Q6Q795 121 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 DCANP1Q8TF63 244 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 PTH2Q96A98 100 aa7.45□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 A0A087WTM6 91 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 K7EQG2 157 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 M0R2P5 195 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 ATXN8Q156A1 80 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 CARD19Q96LW7 228 aa7.44□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 I3L3M4 83 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 RHODO00212 210 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SLC25A20O43772 301 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 TIMM17BO60830 172 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 DAD1P61803 113 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SVIPQ8NHG7 77 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 UPK3BQ9BT76 320 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PRDM15-211ENST00000477633 SPANXCQ9NY87 97 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms