RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 HAMPP81172 84 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 SEC11AP67812 179 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 SYCNQ0VAF6 134 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 FAM104AQ969W3 186 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 DPH3Q96FX2 82 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 C2orf48Q96LS8 159 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 CARD19Q96LW7 228 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 VCX2Q9H322 139 aa8.56□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 TIMM17AQ99595 171 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 MYCBP2O75592 4640 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 LINC01546A6NGU7 62 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 IGIPA6NJ69 53 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 COX6A2Q02221 97 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 C5orf38Q86SI9 138 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 TOMM6Q96B49 74 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 ERASQ7Z444 233 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 AMELXQ99217 191 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-211ENST00000476336 A0A087WZ39 114 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 RNF151Q2KHN1 245 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 FA2HQ7L5A8 372 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 UBE2D1P51668 147 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 SPAG11BQ08648 103 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 A0A087WYN8 130 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 RAB5BP61020 215 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 HERVK_113P63121 156 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 NDUFA1O15239 70 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 MAJINQ3KP22 176 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 PANO1I0J062 215 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 Q6ZRU5 148 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 C7orf33Q8WU49 177 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 A0A096LNI7 61 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 LINC00614P0C842 121 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 CHTF8P0CG12 524 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 STPG4Q8N801 248 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-211ENST00000476336 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 PTTG1IPP53801 180 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 PRSS2P07478 247 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 PMVKQ15126 192 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 Q8IZM0 81 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 HBDP02042 147 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 GAGE2BQ13066 116 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 KIAA0087Q14695 138 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 YPEL4Q96NS1 127 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 J3QL48 77 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 ATP5LO75964 103 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 CXCL5P42830 114 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 CKS1BP61024 79 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 CST9LQ9H4G1 147 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 A0A0J9YXV3 536 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 H3BRM9 83 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-211ENST00000476336 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.4□□□□□ -1.06
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