RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 C7orf33Q8WU49 177 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM18Q96B42 140 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 LRP2P98164 4655 aa7.25□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 ORMDL3Q8N138 153 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.24□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 F8WDY8 70 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 APOMO95445 188 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 C10orf25Q5T742 122 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 PRELID3AQ96N28 172 aa7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 MALP21145 153 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.22□□□□□ -1.25
HDLBP-232ENST00000470482 A0A087WZ39 114 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0J9YXV3 536 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 IGIPA6NJ69 53 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 AMELXQ99217 191 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.21□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 IFITM2Q01629 132 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 SPAG11BQ08648 103 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 GAGE2BQ13066 116 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 CLLU1Q5K131 121 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZRP5 223 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 Q8N8P6 123 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.2□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 MT-ND4LP03901 98 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 ADCYAP1P18509 176 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 UBE2D1P51668 147 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 IMMP2LQ96T52 175 aa7.19□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 IFITM10A6NMD0 228 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 NPSP0C0P6 89 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 ODF1Q14990 250 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.18□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 K7EMI3 77 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 RAB5AP20339 215 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM141Q96I45 108 aa7.17□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 LINC01546A6NGU7 62 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFA1O15239 70 aa7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 FAM168BA1KXE4 195 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM218A2RU14 115 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-232ENST00000470482 RAB14P61106 215 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 RNF213Q63HN8 5207 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 UQCC3Q6UW78 93 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 C2orf82Q6UX34 121 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 REG3GQ6UW15 175 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 TOMM6Q96B49 74 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 TIMM17AQ99595 171 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV7-43P04211 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 VCX2Q9H322 139 aa7.11□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 SEC11CQ9BY50 192 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.1□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 C1orf137Q5JT78 98 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZN92 141 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 ERASQ7Z444 233 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 Q8IZM0 81 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 GNB1LQ9BYB4 327 aa7.09□□□□□ -1.27
HDLBP-232ENST00000470482 MT-ND6P03923 174 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 GAGE2EQ4V326 116 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.08□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.6 ms