RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466539.1

PSME4-204, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 4

Gene PSME4, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-204	ENST00000466539	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539		A0A0J9YY99	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	FGF6	P10767	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	ESRG	Q1W209	222 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PSME4-204	ENST00000466539	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		A0A087WYN8	130 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		F8VRH5	84 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	UBE2D1	P51668	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	AKR1D1	P51857	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	PMVK	Q15126	192 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		Q6ZUT4	128 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	CCL25	O15444	150 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	PKIA	P61925	76 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	RBX1	P62877	108 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		K7EP13	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		Q75L30	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	HTN3	P15516	51 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	PLN	P26678	52 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	KRTDAP	P60985	99 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		Q6ZN92	141 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	C20orf202	A1L168	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	DPM2	O94777	84 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGKC	P01834	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	PRSS1	P07477	247 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	GAGE6	Q13070	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	C12orf57	Q99622	126 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	VCX2	Q9H322	139 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		A0A0J9YXV3	536 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		E9PLD3	99 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	DLEU1	O43261	78 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	SEC11A	P67812	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	COX6A2	Q02221	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539		A0A087WZ39	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	IGLL5	B9A064	214 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	UBE2L6	O14933	153 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	HERVK_113	P63121	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	REG3A	Q06141	175 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	TMEM101	Q96IK0	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PSME4-204	ENST00000466539	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSME4-204	ENST00000466539	SIVA1	O15304	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PSME4-204	ENST00000466539	CCL18	P55774	89 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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