RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP19-210	ENST00000465902	APOM	O95445	188 aa		11.45	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	TOMM6	Q96B49	74 aa		11.45	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		11.45	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	IGIP	A6NJ69	53 aa		11.44	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	YPEL4	Q96NS1	127 aa		11.44	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		11.44	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	EPM2A	B3EWF7	344 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	SCX	Q7RTU7	201 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	DPH3	Q96FX2	82 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	NPS	P0C0P6	89 aa		11.42	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	ERAS	Q7Z444	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		11.42	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	LINC01546	A6NGU7	62 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	FAM229A	H3BQW9	127 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	UBE2D1	P51668	147 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	CARD19	Q96LW7	228 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	AMELX	Q99217	191 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	LINC01549	A6NIU2	74 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	COX6A2	Q02221	97 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	SYCN	Q0VAF6	134 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902		Q5VSD8	79 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
USP19-210	ENST00000465902	LINC00614	P0C842	121 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	RAB5B	P61020	215 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	SPAG11B	Q08648	103 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	CHTF8	P0CG12	524 aa		11.38	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	PANO1	I0J062	215 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		11.37	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WZ39	114 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	PMCHL1	Q16048	86 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	SEC11A	P67812	179 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZRU5	148 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	C2orf48	Q96LS8	159 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	HBD	P02042	147 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	TRGC2	P03986	189 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	NDUFA6	P56556	154 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		11.34	□□□□□ -0.59
USP19-210	ENST00000465902		A0A0J9YXV3	536 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	HERVK_113	P63121	156 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	MAJIN	Q3KP22	176 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	PMVK	Q15126	192 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	CST9L	Q9H4G1	147 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902		A0A096LNI7	61 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902		A0A096LNJ9	63 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	NDUFA1	O15239	70 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	BAGE3	Q86Y29	109 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902		A0A087WYN8	130 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	PRSS2	P07478	247 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		11.3	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	COLCA2	A8K830	154 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902		F8WDY8	70 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	SCO1	O75880	301 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.29	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	ATP5L	O75964	103 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	STPG4	Q8N801	248 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		11.28	□□□□□ -0.6
USP19-210	ENST00000465902	KIAA0087	Q14695	138 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	C10orf25	Q5T742	122 aa		11.27	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	HSBP1	O75506	76 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	CKS1B	P61024	79 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	RNF151	Q2KHN1	245 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	C2orf82	Q6UX34	121 aa		11.26	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	HERC1	Q15751	4861 aa		11.25	□□□□□ -0.61
USP19-210	ENST00000465902	PTTG1IP	P53801	180 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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