RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GCSHP23434 173 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 APOC4P55056 127 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 COX6A2Q02221 97 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf74Q32Q52 190 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.93□□□□□ -1.78
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM243Q9BU79 118 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 MGAM2Q2M2H8 2515 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YXY3 114 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPM0 123 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-210ENST00000462363 SMIM13P0DJ93 91 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-210ENST00000462363 HERVK_113P63121 156 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-210ENST00000462363 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-210ENST00000462363 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.85□□□□□ -1.79
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