RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 SERP2Q8N6R1 65 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 AMELXQ99217 191 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.2□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 LEPROTO15243 131 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 PFN2P35080 140 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TMEM141Q96I45 108 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 A8MTW9 85 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 PPP1R17O96001 155 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 V9GYY9 64 aa6.19□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 I3L3M4 83 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.18□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 GNRH2O43555 120 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TSHBP01222 138 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 MGPP08493 103 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 M0R381 172 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RS1O15537 224 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 NPC2P61916 151 aa6.17□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 IGIPA6NJ69 53 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 ZNF876PQ49A33 203 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 A0A0J9YXY3 114 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 STHQ8IWL8 128 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 TIMM17AQ99595 171 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 MDFIQ99750 246 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 UPK3BQ9BT76 320 aa6.16□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.15□□□□□ -1.42
LMO3-210ENST00000453727 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 DAND5Q8N907 189 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 C9orf85Q96MD7 179 aa6.15□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 NDUFC2O95298 119 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 MUC4Q99102 2169 aa6.14□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.14□□□□□ -1.43
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LMO3-210ENST00000453727 TIRAPP58753 221 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 XCL2Q9UBD3 114 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 USP17L23D6RBM5 183 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 VCYO14598 125 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 PRM2P04554 102 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 FAM236CP0DP71 79 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 INSP01308 110 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 HTN1P15515 57 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 C1orf195Q5TG92 126 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 TMEM243Q9BU79 118 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 MIAQ16674 131 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 DNAL4O96015 105 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 COX7A2LO14548 114 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 NXPH4O95158 308 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 FHL2Q14192 279 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 LITAFQ99732 161 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 A0A087WVE0 104 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 Q6JHZ5 121 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 ANK2Q01484 3957 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-210ENST00000453727 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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