RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 NRACQ8N912 160 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.19□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 F8WDY8 70 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 HBBP68871 147 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.18□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TSPAN13O95857 204 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01551Q86U37 167 aa6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF727A8MUV8 499 aa6.16□□□□□ -1.42
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DDX39B-211ENST00000449757 BLOC1S1P78537 153 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 OSTCQ9NRP0 149 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TCAPO15273 167 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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DDX39B-211ENST00000449757 V9GYV3 84 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf82Q6UX34 121 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 C20orf78Q9BR46 151 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 D6R8Y8 96 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 ATP6V1G1O75348 118 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 TNFRSF6BO95407 300 aa6.13□□□□□ -1.43
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DDX39B-211ENST00000449757 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00862A6NCI5 91 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF861PO60384 105 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 PRSS2P07478 247 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 ADIRFQ15847 76 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 FAM104AQ969W3 186 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.12□□□□□ -1.43
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DDX39B-211ENST00000449757 NDUFA5Q16718 116 aa6.11□□□□□ -1.43
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DDX39B-211ENST00000449757 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
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DDX39B-211ENST00000449757 TMEM141Q96I45 108 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1B0GW15 77 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 F8W036 122 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 S100A8P05109 93 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 CKS1BP61024 79 aa6.09□□□□□ -1.43
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DDX39B-211ENST00000449757 IFITM2Q01629 132 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 C22orf24Q9Y442 160 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-211ENST00000449757 MUC17Q685J3 4493 aa6.08□□□□□ -1.44
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DDX39B-211ENST00000449757 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 CRYGAP11844 174 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 Q6ZN92 141 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 NAT8Q9UHE5 227 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 ORMDL3Q8N138 153 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 PRELID3AQ96N28 172 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 BCE1O60756 84 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 PPBPP02775 128 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 S100A1P23297 94 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-211ENST00000449757 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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