RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TMEM18Q96B42 140 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 TOMM6Q96B49 74 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 LEPROTL1O95214 131 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 REG3AQ06141 175 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 MIAQ16674 131 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 FGF6P10767 208 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 LINC01549A6NIU2 74 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 IFITM10A6NMD0 228 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 H7C423 109 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 ATP5LO75964 103 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 ERASQ7Z444 233 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 TMEM101Q96IK0 257 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 TIMM17AQ99595 171 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 PRR34Q9NV39 138 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GUV1 79 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 IGIPA6NJ69 53 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 USP17L23D6RBM5 183 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 H0Y8G0 127 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZN92 141 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZUT4 128 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 TMEM141Q96I45 108 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-210ENST00000442481 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 KRTDAPP60985 99 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 LINC01620Q4KN68 170 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 PRSS1P07477 247 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 C3orf79P0CE67 100 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 AKR1D1P51857 326 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 VCX2Q9H322 139 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 NPSP0C0P6 89 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 PMVKQ15126 192 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 FAM104AQ969W3 186 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 AMELXQ99217 191 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 hDV102S1A0JD36 115 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 XCL1P47992 114 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 PET117Q6UWS5 81 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZRU5 148 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 CST9LQ9H4G1 147 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-210ENST00000442481 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 C20orf202A1L168 122 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 F8VRH5 84 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 CCL25O15444 150 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 ODF1Q14990 250 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 SS18Q15532 418 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YXV3 536 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 SCGB1D1O95968 90 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 UBE2D1P51668 147 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 LINC01545Q5VT33 79 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 CFAP161Q6P656 301 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms