RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439600.2

LMO3-207, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2

Gene LMO3, Length 1,044 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-207ENST00000439600 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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LMO3-207ENST00000439600 KLK12Q9UKR0 248 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-207ENST00000439600 TENM2Q9NT68 2774 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 LCE6AA0A183 80 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 LEPROTL1O95214 131 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 NFE4Q86UQ8 179 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.33□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 SS18Q15532 418 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 MIAQ16674 131 aa7.32□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.32□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 SEC11AP67812 179 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 PMCHL1Q16048 86 aa7.31□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 A0A096LNJ9 63 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 PMVKQ15126 192 aa7.3□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.29□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 ENHOQ6UWT2 76 aa7.29□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.28□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 IFITM10A6NMD0 228 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 M0R2N4 97 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 AKR1D1P51857 326 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 Q6ZR54 194 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 Q6ZUT4 128 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-207ENST00000439600 BAALCQ8WXS3 180 aa7.28□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 CST9LQ9H4G1 147 aa7.28□□□□□ -1.24
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LMO3-207ENST00000439600 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-207ENST00000439600 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-207ENST00000439600 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-207ENST00000439600 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-207ENST00000439600 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-207ENST00000439600 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-207ENST00000439600 C6orf223Q8N319 242 aa7.27□□□□□ -1.25
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LMO3-207ENST00000439600 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.25□□□□□ -1.25
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LMO3-207ENST00000439600 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.2□□□□□ -1.26
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LMO3-207ENST00000439600 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-207ENST00000439600 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-207ENST00000439600 A0A087WZ39 114 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-207ENST00000439600 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-207ENST00000439600 IGKCP01834 107 aa7.19□□□□□ -1.26
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