RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 BPY2O14599 106 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 SLPIP03973 132 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 K7EP13 123 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 PDE6GP18545 87 aa8.7□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 A0A0B4J2C4 111 aa8.69□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 ACYP1P07311 99 aa8.69□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.69□□□□□ -1.02
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NEK1-201ENST00000439128 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.68□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.68□□□□□ -1.02
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NEK1-201ENST00000439128 COX6A2Q02221 97 aa8.67□□□□□ -1.02
NEK1-201ENST00000439128 LRRK2Q5S007 2527 aa8.67□□□□□ -1.02
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NEK1-201ENST00000439128 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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NEK1-201ENST00000439128 Q8IZM0 81 aa8.65□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 REG3GQ6UW15 175 aa8.64□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.64□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 COL4A2P08572 1712 aa8.63□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.63□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 PLXNB1O43157 2135 aa8.63□□□□□ -1.03
NEK1-201ENST00000439128 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.63□□□□□ -1.03
NEK1-201ENST00000439128 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
NEK1-201ENST00000439128 NRACQ8N912 160 aa8.63□□□□□ -1.03
NEK1-201ENST00000439128 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 H3BT86 120 aa8.59□□□□□ -1.03
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NEK1-201ENST00000439128 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.58□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 EML5Q05BV3 1969 aa8.57□□□□□ -1.04
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NEK1-201ENST00000439128 Q6ZSN1 163 aa8.56□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 TEN1Q86WV5 123 aa8.56□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 TMEM258P61165 79 aa8.56□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.56□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.56□□□□□ -1.04
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NEK1-201ENST00000439128 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.56□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.55□□□□□ -1.04
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NEK1-201ENST00000439128 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.54□□□□□ -1.04
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NEK1-201ENST00000439128 C2orf48Q96LS8 159 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 LST1O00453 97 aa8.53□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 WFDC2Q14508 124 aa8.53□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.53□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 HCFC1P51610 2035 aa8.53□□□□□ -1.04
NEK1-201ENST00000439128 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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NEK1-201ENST00000439128 PTH2Q96A98 100 aa8.52□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 LINC00315P59091 139 aa8.52□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.52□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 F8WDY8 70 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZRU5 148 aa8.51□□□□□ -1.05
NEK1-201ENST00000439128 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.51□□□□□ -1.05
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