RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434703.5

SOX9-AS1-204, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 3,032 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GCSHP23434 173 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LELP1Q5T871 98 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SEC11AP67812 179 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 H3BRM9 83 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 H3BNG1 76 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 FXYD2P54710 66 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 HIST1H4GQ99525 98 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.75□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.75□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.75□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 XCL1P47992 114 aa6.75□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CEND1Q8N111 149 aa6.75□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CCL25O15444 150 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ESRGQ1W209 222 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C5orf38Q86SI9 138 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A0J9YXY3 114 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGHV3-30P01768 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGHV3-33P01772 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TM2D2Q9BX73 214 aa6.74□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TAX1BP3O14907 124 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 REG3AQ06141 175 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 K7ERJ3 54 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PTTG1IPP53801 180 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TAL2Q16559 108 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 B9D2Q9BPU9 175 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 KLK12Q9UKR0 248 aa6.73□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SS18Q15532 418 aa6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A087WZ39 114 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LITAFQ99732 161 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 Q9H8V8 135 aa6.71□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A6NDN8 102 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 RAB37Q96AX2 223 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NDUFA1O15239 70 aa6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 ENHOQ6UWT2 76 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 COX11Q9Y6N1 276 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 IGLL5B9A064 214 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.7□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 COX7B2Q8TF08 81 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRR34Q9NV39 138 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A0U1RRA0 63 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 DAND5Q8N907 189 aa6.69□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 UBE2WQ96B02 151 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TMEM238C9JI98 176 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 NPC2P61916 151 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 PRSS2P07478 247 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SMIM13P0DJ93 91 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 FOXI1Q12951 378 aa6.68□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 COX7A2LO14548 114 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.67□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 H3BUT2 72 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 APOMO95445 188 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A0A1B0GWB2 263 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A4D1N5 150 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CRPP02741 224 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MIAQ16674 131 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C9orf118A6NHY6 69 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C2orf82Q6UX34 121 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 SPANXCQ9NY87 97 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TIMM17BO60830 172 aa6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CFC1BP0CG36 223 aa6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CFC1P0CG37 223 aa6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 MALP21145 153 aa6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.65□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 A6NJY4 79 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 HERV-K104P63124 156 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 KIAA0087Q14695 138 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 VAMP3Q15836 100 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.64□□□□□ -1.35
SOX9-AS1-204ENST00000434703 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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