RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 XP32Q5T750 250 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-208ENST00000428098 Q6ZUT4 128 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.59□□□□□ -1.35
DDX39B-208ENST00000428098 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 UPK1BO75841 260 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 Q5BKY6 102 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 TEX261Q6UWH6 196 aa6.58□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 ENKURQ8TC29 256 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 ST20Q9HBF5 79 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 BATF3Q9NR55 127 aa6.57□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1B0GV50 99 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 XKRY2A2RUG3 117 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 RAB19A4D1S5 217 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 CENPWQ5EE01 88 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00167Q96N53 147 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 FAM210AQ96ND0 272 aa6.56□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF727A8MUV8 499 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 NUDT11Q96G61 164 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.54□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 PFDN1O60925 122 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 IFITM3Q01628 133 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.53□□□□□ -1.36
DDX39B-208ENST00000428098 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 TNFRSF6BO95407 300 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 UBE2AP49459 152 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 C11orf52Q96A22 123 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.52□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 A0A1B0GVG6 124 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE10A6NGK3 116 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 PCOTHQ58A44 107 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 DAND5Q8N907 189 aa6.51□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 VCYO14598 125 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 FCER1GP30273 86 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.5□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 GNG4P50150 75 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 CCL20P78556 96 aa6.49□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 PRLHP81277 87 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.48□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 SMKR1H3BMG3 65 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 RAB4AP20338 218 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 Q8NBF4 154 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM12Q96EX1 92 aa6.47□□□□□ -1.37
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.46□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 IFITM10A6NMD0 228 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 SCO1O75880 301 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 NRACQ8N912 160 aa6.45□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 K7EN84 100 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 AMN1Q8IY45 258 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 KIR2DL4Q99706 377 aa6.44□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 SPINK1P00995 79 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 HBBP68871 147 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 Q8N377 158 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 BIN3Q9NQY0 253 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 GNG13Q9P2W3 67 aa6.43□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV2D-28P01615 120 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 OCC1Q8TAD7 63 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM18Q96B42 140 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.42□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM238C9JI98 176 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 CKS1BP61024 79 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 MED9Q9NWA0 146 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.41□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 SPRR4Q96PI1 79 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.4□□□□□ -1.38
DDX39B-208ENST00000428098 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM126AQ9H061 195 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.39□□□□□ -1.39
DDX39B-208ENST00000428098 UMAD1C9J7I0 102 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-208ENST00000428098 PRSS2P07478 247 aa6.38□□□□□ -1.39
DDX39B-208ENST00000428098 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms