RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 PRB1P04280 392 aa5.09□□□□□ -1.59
ALMS1-201ENST00000423048 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.09□□□□□ -1.59
ALMS1-201ENST00000423048 ACACAQ13085 2346 aa5.09□□□□□ -1.59
ALMS1-201ENST00000423048 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.09□□□□□ -1.59
ALMS1-201ENST00000423048 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.09□□□□□ -1.59
ALMS1-201ENST00000423048 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.08□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.08□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0J9YWU9 116 aa5.08□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.08□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 C10orf25Q5T742 122 aa5.08□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZQY7 126 aa5.07□□□□□ -1.6
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ALMS1-201ENST00000423048 C20orf197Q8N268 126 aa5.06□□□□□ -1.6
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ALMS1-201ENST00000423048 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.05□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 EML5Q05BV3 1969 aa5.05□□□□□ -1.6
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ALMS1-201ENST00000423048 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ALMS1-201ENST00000423048 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa5.04□□□□□ -1.6
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ALMS1-201ENST00000423048 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.03□□□□□ -1.6
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ALMS1-201ENST00000423048 SVIPQ8NHG7 77 aa5.02□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 C1orf137Q5JT78 98 aa5.02□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.02□□□□□ -1.61
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ALMS1-201ENST00000423048 CASC2Q6XLA1 102 aa5□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 XAGE1AQ9HD64 81 aa5□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 CELA1Q9UNI1 258 aa5□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 TLX1NBP0CAT3 122 aa5□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 ESM1Q9NQ30 184 aa5□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 C2CD3Q4AC94 2353 aa5□□□□□ -1.61
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ALMS1-201ENST00000423048 CDIP1Q9H305 208 aa4.99□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.99□□□□□ -1.61
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ALMS1-201ENST00000423048 Q6ZVQ6 151 aa4.99□□□□□ -1.61
ALMS1-201ENST00000423048 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.99□□□□□ -1.61
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ALMS1-201ENST00000423048 AVPP01185 164 aa4.97□□□□□ -1.61
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ALMS1-201ENST00000423048 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.96□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.96□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.96□□□□□ -1.62
ALMS1-201ENST00000423048 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.96□□□□□ -1.62
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