RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A087WZ39 114 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 IGIPA6NJ69 53 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 OXLD1Q5BKU9 147 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A096LNI7 61 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV1-51P01701 117 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF580Q9UK33 172 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 EML5Q05BV3 1969 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 UPK3BQ9BT76 320 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 COX8CQ7Z4L0 72 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRJ-201ENST00000418331 MT-ATP8P03928 68 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 POM121L12Q8N7R1 296 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV2D-28P01615 120 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0J9YWU9 116 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 Q8IZM0 81 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF462Q96JM2 2506 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R378 163 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 LST1O00453 97 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZQY7 126 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRK2Q5S007 2527 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf47Q569G3 176 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 SCXQ7RTU7 201 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf95Q9H693 158 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 COX17Q14061 63 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 CCKP06307 115 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 LRCOL1A6NCL2 159 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 CYSRT1A8MQ03 144 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 ENHOQ6UWT2 76 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 J3KT08 172 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R2N4 97 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PKD1L2Q7Z442 2459 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 FASNP49327 2511 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC7Q8TAX7 377 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RETNQ9HD89 108 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTS20P59510 1910 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00694P0DN24 101 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 FHL2Q14192 279 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 C20orf197Q8N268 126 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A096LNJ9 63 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV4-1P06312 121 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf84H3BNL1 204 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MTORP42345 2549 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 COX6A2Q02221 97 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.33■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.33■□□□□ 0.05
PTPRJ-201ENST00000418331 UQCRQO14949 82 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 AMELXQ99217 191 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 C7orf33Q8WU49 177 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZSN1 163 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZTC4 211 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PTPRJ-201ENST00000418331 LY6G6CO95867 125 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 IMUPQ9GZP8 106 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 POLQO75417 2590 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf22Q8N5N4 141 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00474Q9P2X8 69 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 Q8N2B8 174 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 AGRNO00468 2067 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 USP17L23D6RBM5 183 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GUV1 79 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms