RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 DAD1P61803 113 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-203ENST00000395211 E7EQL1 145 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZSN1 163 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 Q8N3U1 123 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 PSPHP1O15172 72 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 CCL18P55774 89 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 ACACAQ13085 2346 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 MUC3AQ02505 3323 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 C19orf84I3L1E1 186 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 ESRGQ1W209 222 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 AKAP13Q12802 2813 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 Q8N6K4 173 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.321e-8■□□□□ 10.2
TMOD1-203ENST00000395211 M0R2N4 97 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 NDUFC1O43677 76 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 COX7B2Q8TF08 81 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.79□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM89A2RUT3 159 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 ODF3BA8MYP8 253 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 NREPQ16612 68 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 NDUFA4O00483 81 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZVQ6 151 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF843Q8N446 348 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 COL12A1Q99715 3063 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 CFHR3Q02985 330 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-53P01767 116 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 CD164Q04900 197 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 LY6EQ16553 131 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 PRR15Q8IV56 129 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 Q8N814 137 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 Q8N9L7 120 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 CUBNO60494 3623 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 ZFHX3Q15911 3703 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 GNLYP22749 145 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 LINC01560Q8TB33 94 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 K7EQG2 157 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 PRYO14603 147 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 UBE2L6O14933 153 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 BPY2O14599 106 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 PRR4Q16378 134 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 C6orf223Q8N319 242 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 SPG11Q96JI7 2443 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF292O60281 2723 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 A8MTW9 85 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 BCE1O60756 84 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZQT0 140 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZRU5 148 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 A8MU10 97 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 C6orf99Q4VX62 202 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 CELA1Q9UNI1 258 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD1-203ENST00000395211 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.68□□□□□ -1.34
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