RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.41□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 MTORP42345 2549 aa7.41□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 UBE2D1P51668 147 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 GAS8-AS1O95177 125 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 G3V4G9 280 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 H0Y9J4 135 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 FHL2Q14192 279 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.4□□□□□ -1.22
PKP4-201ENST00000389757 A8MZ25 164 aa7.4□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 TAX1BP3O14907 124 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 IGKV2D-28P01615 120 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 M0R378 163 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GX51 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 TIMM17BO60830 172 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 C6orf99Q4VX62 202 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 Q8IZM0 81 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 WFDC2Q14508 124 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 MP68P56378 58 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 POLQO75417 2590 aa7.38□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 YPEL4Q96NS1 127 aa7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 COX17Q14061 63 aa7.37□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 MUC7Q8TAX7 377 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 TCL1BO95988 128 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 FHL3Q13643 280 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 PTPRBP23467 1997 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 IGIPA6NJ69 53 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 PTH2Q96A98 100 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-201ENST00000389757 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 SLPIP03973 132 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 FOXI1Q12951 378 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 ACANP16112 2415 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.33□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.31□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 FSHBP01225 129 aa7.3□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 Q6ZQY7 126 aa7.3□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 A0A1B0GUV1 79 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 ATOX1O00244 68 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 C6orf223Q8N319 242 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-201ENST00000389757 CELA1Q9UNI1 258 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 UPK3BQ9BT76 320 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-201ENST00000389757 F8WDY8 70 aa7.27□□□□□ -1.25
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PKP4-201ENST00000389757 LINC00643Q86TS7 51 aa7.27□□□□□ -1.25
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PKP4-201ENST00000389757 AMELXQ99217 191 aa7.26□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 C2orf48Q96LS8 159 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.25□□□□□ -1.25
PKP4-201ENST00000389757 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.25□□□□□ -1.25
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