RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 BPESC1Q9GZL8 116 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 Q9UF83 564 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 hDV103S1A0JD37 113 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 H0YGX0 51 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CCL21O00585 134 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 DNAL4O96015 105 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV1-47P01700 117 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV1-2P23083 117 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEA5P43359 124 aa2.31□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 SPANXN1Q5VSR9 72 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 ZNRD1Q9P1U0 126 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00588Q9Y4M8 146 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 ICE1Q9Y2F5 2266 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CEP350Q5VT06 3117 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 MED13LQ71F56 2210 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CUL9Q8IWT3 2517 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 M0QY20 66 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CD28P10747 220 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CXCL6P80162 114 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 NPBQ8NG41 125 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 RMI2Q96E14 147 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 RETNQ9HD89 108 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 M0R1B8 84 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFB3O43676 98 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 LY6HO94772 140 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV2D-28P01615 120 aa2.29□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 DEFB133Q30KQ1 61 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 LY6G5BQ8NDX9 201 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 KAAG1Q9UBP8 84 aa2.29□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 TECTAO75443 2155 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 EPOPA6NHQ4 379 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 A6NN06 94 aa2.28□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZVQ6 151 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2E2Q96LR5 201 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRC-202ENST00000367364 DEFB127Q9H1M4 99 aa2.28□□□□□ -2.04
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PTPRC-202ENST00000367364 UTRNP46939 3433 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 M0R378 163 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFS5O43920 106 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 DEFB114Q30KQ6 69 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 Q6ZQT0 140 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 Q8N6K4 173 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.27□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 DYNLRB2Q8TF09 96 aa2.27□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 Q9HAA7 133 aa2.27□□□□□ -2.05
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PTPRC-202ENST00000367364 ZFHX3Q15911 3703 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 A0A096LNT2 108 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 ODF3BA8MYP8 253 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 K7EQG2 157 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 NCR3O14931 201 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 IGHV1-46P01743 117 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 MGPP08493 103 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRC-202ENST00000367364 DAD1P61803 113 aa2.26□□□□□ -2.05
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