RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 SS18Q15532 418 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 PRR34Q9NV39 138 aa14.8□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 EREGO14944 169 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM170BQ5T4T1 132 aa14.79□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 MAJINQ3KP22 176 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 ENHOQ6UWT2 76 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 hDV102S1A0JD36 115 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 HERVK_113P63121 156 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 COX6A2Q02221 97 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.78□□□□□ -0.04
HOXA4-201ENST00000360046 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 CCL25O15444 150 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 XCL1P47992 114 aa14.77□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 STPG4Q8N801 248 aa14.76□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 MIAQ16674 131 aa14.75□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.74□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 LY6G6CO95867 125 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 Q9HAA7 133 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 H3BRM9 83 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 K7EP13 123 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA4-201ENST00000360046 HERVK_113P61574 105 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM223A0PJW6 202 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 SPINK8P0C7L1 97 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 CD164L2Q6UWJ8 174 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 GAGE12HA6NDE8 117 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 C5orf38Q86SI9 138 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 TTC32Q5I0X7 151 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 NMUP48645 174 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 FOXI1Q12951 378 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 A0A087WZ39 114 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 COX7A2LO14548 114 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA4-201ENST00000360046 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 E9PLD3 99 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 RMI2Q96E14 147 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 M0R2N4 97 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 MALP21145 153 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 ALMS1Q8TCU4 4167 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 BATFQ16520 125 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 LEPROTO15243 131 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHB2Q96CS7 222 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 J3QQQ9 107 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 TSPEAR-AS2P59090 65 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXA4-201ENST00000360046 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 PCP2Q8IVA1 136 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 COX8AP10176 69 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 APOMO95445 188 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 COX11Q9Y6N1 276 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 TM2D2Q9BX73 214 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 COX7B2Q8TF08 81 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 KMT2AQ03164 3969 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 PSCAO43653 123 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 PRSS2P07478 247 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF815PA8K554 130 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXA4-201ENST00000360046 DLEU1O43261 78 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 Q6ZR54 194 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 C6orf226Q5I0X4 101 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 SPAG11BQ08648 103 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 CFAP161Q6P656 301 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 Q8IZM0 81 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 DNAH6Q9C0G6 4158 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 LCE6AA0A183 80 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXA4-201ENST00000360046 C15orf56Q8N910 161 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms