RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317896.11

HFE-202, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HFE, Length 1,922 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-202ENST00000317896 INSP01308 110 aa10.09□□□□□ -0.79
HFE-202ENST00000317896 LINC01587Q99440 93 aa10.09□□□□□ -0.79
HFE-202ENST00000317896 PEMTQ9UBM1 199 aa10.09□□□□□ -0.79
HFE-202ENST00000317896 NACAE9PAV3 2078 aa10.08□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 IMUPQ9GZP8 106 aa10.08□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 PPDPFQ9H3Y8 114 aa10.08□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 Q6ZSN1 163 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 Q6ZSV7 163 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 Q9H8V8 135 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 HERV-K104P63124 156 aa10.07□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.06□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 TRACP01848 142 aa10.06□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 DAND5Q8N907 189 aa10.05□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.05□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 MEIG1Q5JSS6 88 aa10.05□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 DYNLRB2Q8TF09 96 aa10.05□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 ZNF702PQ9H963 129 aa10.04□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 SLURP1P55000 103 aa10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 MAP6D1Q9H9H5 199 aa10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 LINC00643Q86TS7 51 aa10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.03□□□□□ -0.8
HFE-202ENST00000317896 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.02□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 TMEM126AQ9H061 195 aa10.02□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 PF4P02776 101 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 ATP5G1P05496 136 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 COX6A2Q02221 97 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 FAM222AQ5U5X8 452 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 Q9UF83 564 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 TMEM86BQ8N661 226 aa10.01□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 WIPF1O43516 503 aa10□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 Q6YL49 198 aa10□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 FAM110AQ9BQ89 295 aa10□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 K7EQD1 137 aa9.99□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.99□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 PRM2P04554 102 aa9.99□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.99□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.99□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 CXCL5P42830 114 aa9.98□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 A0A0U1RRA0 63 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 UBE2L6O14933 153 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 CRPP02741 224 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 NDUFA7O95182 113 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 DEFB136Q30KP8 78 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 IL17DQ8TAD2 202 aa9.97□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.96□□□□□ -0.81
HFE-202ENST00000317896 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 F5H768 121 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 STHQ8IWL8 128 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 LINC00694P0DN24 101 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 Q8N2B8 174 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 TMEM243Q9BU79 118 aa9.95□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 MALP21145 153 aa9.94□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.94□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.94□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.94□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.94□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 XCL2Q9UBD3 114 aa9.94□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.93□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 DNAL4O96015 105 aa9.93□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 COX7B2Q8TF08 81 aa9.93□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.92□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.92□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 UQCRQO14949 82 aa9.92□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa9.92□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 H0YGX0 51 aa9.91□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.91□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.91□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.91□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 C5orf38Q86SI9 138 aa9.9□□□□□ -0.82
HFE-202ENST00000317896 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms