RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299339.2

CLDN10-201, Transcript of claudin 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN10, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10-201ENST00000299339 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.59□□□□□ -1.67
CLDN10-201ENST00000299339 NFE4Q86UQ8 179 aa4.59□□□□□ -1.67
CLDN10-201ENST00000299339 STPG4Q8N801 248 aa4.59□□□□□ -1.67
CLDN10-201ENST00000299339 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CLDN10-201ENST00000299339 CST9LQ9H4G1 147 aa4.59□□□□□ -1.67
CLDN10-201ENST00000299339 C11orf86A6NJI1 115 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 HSD52Q0P140 79 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 GAGE1Q13065 139 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 COTL1Q14019 142 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 AMELXQ99217 191 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 VCX2Q9H322 139 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 APOC4P55056 127 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 OR11H2Q8NH07 326 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.57□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 A6NDN8 102 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 LYRM9A8MSI8 78 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 K7EQD1 137 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 NMUP48645 174 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TIRAPP58753 221 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 MPV17L2Q567V2 206 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 Q6ZR54 194 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TM2D2Q9BX73 214 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.56□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 LRP2P98164 4655 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 A0A1B0GV90 55 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 H3BRM9 83 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 UBE2D3P61077 147 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 UBE2D2P62837 147 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 Q5VSD8 79 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.55□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 MIFP14174 115 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 Q6ZTI0 123 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 PCP2Q8IVA1 136 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF479Q96JC4 524 aa4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM223A0PJW6 202 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 LEPROTO15243 131 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 PRM2P04554 102 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 BATFQ16520 125 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 NACAE9PAV3 2078 aa4.53□□□□□ -1.68
CLDN10-201ENST00000299339 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 CCL25O15444 150 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 GAGE7O76087 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 GAGE12FP0CL80 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 GAGE12GP0CL81 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 GAGE12IP0CL82 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 SMIM13P0DJ93 91 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 HERVK_113P63121 156 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 Q6ZVH6 145 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 CEND1Q8N111 149 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 FAM104AQ969W3 186 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 TMEM243Q9BU79 118 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 PRO0255Q9UI72 69 aa4.52□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 A0A1B0GWB2 263 aa4.51□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 ZNF815PA8K554 130 aa4.51□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 J3QQQ9 107 aa4.51□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 TAX1BP3O14907 124 aa4.51□□□□□ -1.69
CLDN10-201ENST00000299339 LINC00694P0DN24 101 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms