RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.97□□□□□ -1.29
CUX1-201ENST00000292535 IGLV2-14P01704 120 aa6.96□□□□□ -1.29
CUX1-201ENST00000292535 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.96□□□□□ -1.29
CUX1-201ENST00000292535 NUPR2A6NF83 97 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 NUPR1O60356 82 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 UBE2D2P62837 147 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 C10orf25Q5T742 122 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 IMUPQ9GZP8 106 aa6.96□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 LY6G6CO95867 125 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 TDRG1Q3Y452 100 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.95□□□□□ -1.3
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CUX1-201ENST00000292535 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.95□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 TRIAP1O43715 76 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 P0C879 139 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 SLPIP03973 132 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.94□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 C3orf84H3BNL1 204 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 M0R2N4 97 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZVQ6 151 aa6.93□□□□□ -1.3
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CUX1-201ENST00000292535 SERP2Q8N6R1 65 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 PRYO14603 147 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 A0A0C4DFX4 3053 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 NDUFA7O95182 113 aa6.93□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 RNF185Q96GF1 192 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 U3KQK5 164 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 Q8IZM0 81 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 EBI3Q14213 229 aa6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 DCANP1Q8TF63 244 aa6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 IGLV2-8P01709 118 aa6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 ZNF843Q8N446 348 aa6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.91□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 CR1P17927 2039 aa6.9□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.9□□□□□ -1.3
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CUX1-201ENST00000292535 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.9□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.9□□□□□ -1.3
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZSV7 163 aa6.9□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.9□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.9□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 IGKV2D-28P01615 120 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 Q6ZQY7 126 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 LY6G6DO95868 133 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.89□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 KLLNB2CW77 178 aa6.88□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.88□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 RBX1P62877 108 aa6.88□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 Q6JHZ5 121 aa6.88□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.87□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 VPREB1P12018 145 aa6.87□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.87□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 TRANK1O15050 2925 aa6.87□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 F8WDY8 70 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 RETNQ9HD89 108 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 SNURFQ9Y675 71 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CRIP1P50238 77 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 FSHBP01225 129 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 PLA2G2AP14555 144 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 LST1O00453 97 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 REG3GQ6UW15 175 aa6.86□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.85□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.85□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CFAP54Q96N23 3096 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 CEP350Q5VT06 3117 aa6.84□□□□□ -1.31
CUX1-201ENST00000292535 ZNF292O60281 2723 aa6.84□□□□□ -1.31
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