RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260356.5

THBS1-201, Transcript of thrombospondin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS1, Length 7,775 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS1-201ENST00000260356 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 Q6ZVQ6 151 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 C10orf25Q5T742 122 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 RNF185Q96GF1 192 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.48□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 FSTL3O95633 263 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 PMAIP1Q13794 54 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 RBX1P62877 108 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 LELP1Q5T871 98 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 NRACQ8N912 160 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.47□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 MBD6Q96DN6 1003 aa8.46□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 PRR4Q16378 134 aa8.46□□□□□ -1.05
THBS1-201ENST00000260356 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.46□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.45□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 TSHBP01222 138 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 PRYO14603 147 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 PROK1P58294 105 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 UBE2D2P62837 147 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 MSMPQ1L6U9 139 aa8.44□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.43□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.43□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 CCDC179H3BU77 68 aa8.43□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.43□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 Q6Q795 121 aa8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 Q6JHZ5 121 aa8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 Q8IZM0 81 aa8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 EBI3Q14213 229 aa8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 Q8NA96 180 aa8.42□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 MTORP42345 2549 aa8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 LINC00694P0DN24 101 aa8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 A8MZ25 164 aa8.4□□□□□ -1.06
THBS1-201ENST00000260356 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 ESRGQ1W209 222 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 INAFM1C9JVW0 142 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 LINC00208Q96KT6 92 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.39□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 IGLV2-11P01706 119 aa8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 KLLNB2CW77 178 aa8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CELA1Q9UNI1 258 aa8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 COL4A3Q01955 1670 aa8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 XGP55808 180 aa8.38□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 Q6ZSV7 163 aa8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 Q6ZS46 218 aa8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.37□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 Q8N814 137 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 YPEL4Q96NS1 127 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 M0R2N4 97 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 C1orf137Q5JT78 98 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CNFNQ9BYD5 112 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.36□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 BPTFQ12830 3046 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 USP24Q9UPU5 2620 aa8.35□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 REG3GQ6UW15 175 aa8.34□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 PRORYQ9H606 182 aa8.34□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 CENPFP49454 3210 aa8.34□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 M0QXV9 152 aa8.34□□□□□ -1.07
THBS1-201ENST00000260356 Q6ZPA2 131 aa8.33□□□□□ -1.08
THBS1-201ENST00000260356 LY6G6CO95867 125 aa8.33□□□□□ -1.08
THBS1-201ENST00000260356 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.33□□□□□ -1.08
THBS1-201ENST00000260356 X6R8D5 127 aa8.33□□□□□ -1.08
THBS1-201ENST00000260356 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
THBS1-201ENST00000260356 POLQO75417 2590 aa8.33□□□□□ -1.08
THBS1-201ENST00000260356 PLA2G5P39877 138 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111 ms