RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 STAB2Q8WWQ8 2551 aa18.81■□□□□ 0.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa18.79■□□□□ 0.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 Q9H8V8 135 aa18.52■□□□□ 0.56
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 IMUPQ9GZP8 106 aa18.5■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TRACP01848 142 aa18.49■□□□□ 0.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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