RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFC2O95298 119 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 VPREB1P12018 145 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 RBX1P62877 108 aa4.72□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFS5O43920 106 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 PCSK5Q92824 1860 aa4.71□□□□□ -1.65
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 SVIPQ8NHG7 77 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 IGIPA6NJ69 53 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 Q8N2B8 174 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 Q8IZM0 81 aa4.71□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 KRTAP10-9P60411 292 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 MP68P56378 58 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 RNF183Q96D59 192 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM258P61165 79 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 SYCNQ0VAF6 134 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 CACNA1HO95180 2353 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 TRIAP1O43715 76 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.7□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GX51 115 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 F8WDY8 70 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 M0R378 163 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 EDN2P20800 178 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.69□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 ABCA4P78363 2273 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00310P59036 64 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01546A6NGU7 62 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 Q8N976 141 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 GAS8-AS1O95177 125 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.68□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRBP23467 1997 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 C5orf47Q569G3 176 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 AMELXQ99217 191 aa4.67□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LST1O00453 97 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 SPTBN2O15020 2390 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP6Q13023 2319 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0J9YWU9 116 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 FHL2Q14192 279 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 UPK3BQ9BT76 320 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 NACAE9PAV3 2078 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 NUPR2A6NF83 97 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 BPY2O14599 106 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.65□□□□□ -1.66
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087WZ39 114 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf99Q4VX62 202 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 KLK9Q2XQG4 91 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 SMR3AQ99954 134 aa4.65□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 A8MZ25 164 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1B0GUV1 79 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 B5MCH6 92 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 PRM2P04554 102 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 C7orf33Q8WU49 177 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 IMUPQ9GZP8 106 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 PLCE1Q9P212 2302 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.64□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 H0Y9J4 135 aa4.63□□□□□ -1.67
PDE4D-228ENST00000636120 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.63□□□□□ -1.67
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