RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.31□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 PMAIP1Q13794 54 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZVQ6 151 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 CCKP06307 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 EBI3Q14213 229 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF843Q8N446 348 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.3□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 IGIPA6NJ69 53 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A087WVE0 104 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 NCKAP5O14513 1909 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.29□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 PRYO14603 147 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 FSTL3O95633 263 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 SLPIP03973 132 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 C3orf84H3BNL1 204 aa7.28□□□□□ -1.24
SPTAN1-228ENST00000635853 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 Q6ZSV7 163 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 X6R8D5 127 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 RP1P56715 2156 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 CCDC140Q96MF4 163 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8N9L7 120 aa7.27□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 CACNA1DQ01668 2161 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 IGLV1-47P01700 117 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 SPTBN2O15020 2390 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 TSHBP01222 138 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 ABCA4P78363 2273 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 RTTNQ86VV8 2226 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 M0QY20 66 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 M0R378 163 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 Q8NA96 180 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 SEC16AO15027 2179 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 ODF3BA8MYP8 253 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 C10orf25Q5T742 122 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 CACNA1BQ00975 2339 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 LMO4P61968 165 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 K7EQG2 157 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 BCE1O60756 84 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 EML5Q05BV3 1969 aa7.21□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 A8MZ25 164 aa7.21□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 LELP1Q5T871 98 aa7.21□□□□□ -1.25
SPTAN1-228ENST00000635853 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 A6NED7 52 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 PLA2G2AP14555 144 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.21□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 C6orf99Q4VX62 202 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 GTF3C1Q12789 2109 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 WISP2O76076 250 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 BRI3O95415 125 aa7.2□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 ESRGQ1W209 222 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 LINC00846Q9NV44 126 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 MED12Q93074 2177 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 PI4KAP42356 2102 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SPTAN1-228ENST00000635853 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.19□□□□□ -1.26
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