RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CNFNQ9BYD5 112 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE6DO43924 150 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MRAP2Q96G30 205 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK2N2Q96S95 79 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX46H3BTG2 121 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM242Q9NWH2 141 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 APOMO95445 188 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 DIRC1Q969H9 104 aa16.68■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 COX7A2LO14548 114 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP35Q8NFH5 326 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TSHBP01222 138 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ESDP10768 282 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ST20Q9HBF5 79 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-217ENST00000629983 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HMSDA8MTL9 139 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV7-43P04211 117 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR4Q16378 134 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf77A4D0Y5 90 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WZ39 114 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC2Q02817 5179 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RQV1 116 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EN84 100 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf48Q96LS8 159 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y9J4 135 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf38Q86SI9 138 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG11BQ08648 103 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OCC1Q8TAD7 63 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 BORCS7Q96B45 105 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM210AQ96ND0 272 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FCER1GP30273 86 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS21Q2M5E4 152 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TSKUQ8WUA8 353 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2D1P51668 147 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MWL6 223 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAGPQ0VAQ4 97 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF151Q2KHN1 245 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 BATF3Q9NR55 127 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM168BA1KXE4 195 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 IMMP2LQ96T52 175 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZUT4 128 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 ORAOV1Q8WV07 137 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 VCYO14598 125 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-217ENST00000629983 SMKR1H3BMG3 65 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2BP63146 152 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 AMN1Q8IY45 258 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB4AP20338 218 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUT8 65 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA1O15239 70 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM231DQ6ZW35 169 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DL4Q99706 377 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE2EQ4V326 116 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 GAGE2DQ9UEU5 116 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CT83Q5H943 113 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM18Q96B42 140 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 CEBPGP53567 150 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-217ENST00000629983 HIGD1CA8MV81 97 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 F8WDY8 70 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QXV9 152 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf25Q5T742 122 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R17O96001 155 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM241Q24JQ0 296 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM21Q9BVV7 248 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 C6orf48Q9UBA6 75 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 FAT4Q6V0I7 4981 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TLX1NBP0CAT3 122 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 SMDT1Q9H4I9 107 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM250H0YL14 139 aa16.34■□□□□ 0.21
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