RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 HLA-DQA1P01909 254 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 APCSP02743 223 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 MT-ND6P03923 174 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.53□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 VCYO14598 125 aa7.53□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 TNFRSF6BO95407 300 aa7.53□□□□□ -1.2
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CCL3L3-201ENST00000612839 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 C20orf78Q9BR46 151 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR34Q9NV39 138 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 C5orf52A6NGY3 159 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 EREGO14944 169 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 Q0VG73 95 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 ORMDL3Q8N138 153 aa7.52□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 TM2D2Q9BX73 214 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 COX11Q9Y6N1 276 aa7.51□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 S100A6P06703 90 aa7.5□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 REG3AQ06141 175 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 WFDC2Q14508 124 aa7.5□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 PRELID3AQ96N28 172 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 KIR2DL4Q99706 377 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.49□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 C16orf90A8MZG2 172 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 FCER1GP30273 86 aa7.49□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N814 137 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL3L3-201ENST00000612839 BAALCQ8WXS3 180 aa7.48□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.48□□□□□ -1.21
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CCL3L3-201ENST00000612839 TCAPO15273 167 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00310P59036 64 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.46□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCL3L3-201ENST00000612839 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM101Q96IK0 257 aa7.45□□□□□ -1.22
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CCL3L3-201ENST00000612839 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N8P6 123 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM18Q96B42 140 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 SERF1AO75920 110 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 BAGE3Q86Y29 109 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L23D6RBM5 183 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL3L3-201ENST00000612839 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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