RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606486.1

TATDN3-217, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

Gene TATDN3, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-217ENST00000606486 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-2.47□□□□□ -2.8
TATDN3-217ENST00000606486 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 ADAMTS12P58397 1594 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 CLPSL1A2RUU4 121 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 PSPHP78330 225 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 MAFIPQ8WZ33 124 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 SLIT1O75093 1534 aa-2.48□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 FAM107AO95990 144 aa-2.49□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 KDM5CP41229 1560 aa-2.49□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 A0A087WVE0 104 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 ALX1Q15699 326 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 TMED4Q7Z7H5 227 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 STX12Q86Y82 276 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 THEM6Q8WUY1 208 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 DMDP11532 3685 aa-2.5□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 FAM92AA1XBS5 289 aa-2.51□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 SMIM6P0DI80 62 aa-2.51□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 TMEM78Q5T7P6 136 aa-2.51□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-2.51□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 SERPINB1P30740 379 aa-2.52□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-2.52□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-2.53□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 J3QLW9 94 aa-2.53□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 UBE2D1P51668 147 aa-2.53□□□□□ -2.81
TATDN3-217ENST00000606486 SPEGQ15772 3267 aa-2.53□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 A0A1W2PRE2 83 aa-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 E7EQ34 232 aa-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 H0YJX3 145 aa-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 DEFB4AO15263 64 aa-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 SYNMO15061 1565 aa-2.55□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 RBP4P02753 201 aa-2.55□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 CCDC115Q96NT0 180 aa-2.55□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 NDUFA12Q9UI09 145 aa-2.55□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 PFDN1O60925 122 aa-2.56□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 C10orf82Q8WW14 230 aa-2.56□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 BOLA2Q9H3K6 86 aa-2.56□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-2.57□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 IFNGP01579 166 aa-2.57□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 LINC01545Q5VT33 79 aa-2.57□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 LRRC37A3O60309 1634 aa-2.57□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 ARHGEF5Q12774 1597 aa-2.57□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 LRRC37A2A6NM11 1700 aa-2.58□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 HLA-DRB4P13762 266 aa-2.58□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 DEFB123Q8N688 67 aa-2.58□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.58□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 CLLU1Q5K131 121 aa-2.59□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
TATDN3-217ENST00000606486 CCL18P55774 89 aa-2.6□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 RPRMQ9NS64 109 aa-2.6□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 STOML2Q9UJZ1 356 aa-2.6□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 MAP3K1Q13233 1512 aa-2.6□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 WFDC9Q8NEX5 89 aa-2.61□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 NSD3Q9BZ95 1437 aa-2.61□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 FMN2Q9NZ56 1722 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 DOCK1Q14185 1865 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 SMIM24O75264 130 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 SMIM4Q8WVI0 70 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 BANF2Q9H503 90 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 CALML5Q9NZT1 146 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 APLNQ9ULZ1 77 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 CEP350Q5VT06 3117 aa-2.62□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 MT-ND4LP03901 98 aa-2.63□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 MYH8P13535 1937 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 ERCC6Q03468 1493 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 IFNA17P01571 189 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 PAEPP09466 180 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-2.64□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 PRDM2Q13029 1718 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 ZNF236Q9UL36 1845 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 MYH13Q9UKX3 1938 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 DPM2O94777 84 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 PIRTP0C851 137 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 COX8AP10176 69 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 MNS1Q8NEH6 495 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 LINC01600Q96MT4 127 aa-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP-2.65□□□□□ -2.83
TATDN3-217ENST00000606486 NEFHP12036 1026 aa-2.66□□□□□ -2.84
TATDN3-217ENST00000606486 UBE2D3P61077 147 aa-2.66□□□□□ -2.84
TATDN3-217ENST00000606486 UBE2D2P62837 147 aa-2.66□□□□□ -2.84
TATDN3-217ENST00000606486 Q6JHZ5 121 aa-2.66□□□□□ -2.84
TATDN3-217ENST00000606486 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-2.66□□□□□ -2.84
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