RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598362.1

GRAMD1A-208, Transcript of GRAM domain containing 1A, human

TSL 2

Gene GRAMD1A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362		Q8N8P6	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RMI2	Q96E14	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PSCA	O43653	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	REG3A	Q06141	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MIA	Q16674	131 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362		A0A087WTM6	91 aa		5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RAB5A	P20339	215 aa		5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM18	Q96B42	140 aa		5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SCO1	O75880	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	WFDC2	Q14508	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362		Q6ZUT4	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HSPG2	P98160	4391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362		K7EMI3	77 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EREG	O14944	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LECT2	O14960	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362		Q8N814	137 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	COLCA2	A8K830	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362		J3QL48	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CCL25	O15444	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRGC2	P03986	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	XCL1	P47992	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NPS	P0C0P6	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	S100A1	P23297	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	G0S2	P27469	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FOXI1	Q12951	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SS18	Q15532	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362		Q6ZN92	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362		A0A096LNJ9	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HBD	P02042	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LINC00614	P0C842	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RAB5B	P61020	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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