RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 RHOHQ15669 191 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 PRSS47A8MTI9 375 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 PMCHP20382 165 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 PRO0255Q9UI72 69 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 CRYBA4P53673 196 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 FA2HQ7L5A8 372 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NIT1Q86X76 327 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 Q8N8P6 123 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 Q9UF83 564 aa7.15□□□□□ -1.26
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE12JA6NER3 117 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 VCYO14598 125 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 SERF1AO75920 110 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00614P0C842 121 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE1Q13065 139 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE4Q13068 117 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE5Q13069 117 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE13Q4V321 117 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZSA8 131 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 Q9HAA7 133 aa7.14□□□□□ -1.27
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TOP3A-210ENST00000580713 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 I3L3M4 83 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 GYPEP15421 78 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00310P59036 64 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.13□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 HSBP1O75506 76 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2D3P61077 147 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2D2P62837 147 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 SCXQ7RTU7 201 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 KIR2DL4Q99706 377 aa7.12□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01546A6NGU7 62 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 C5orf52A6NGY3 159 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 K7EMI3 77 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 TCAPO15273 167 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 NUPR1O60356 82 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00694P0DN24 101 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 ESDP10768 282 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LAGE3Q14657 143 aa7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 FCER1GP30273 86 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 COTL1Q14019 142 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.1□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 TSHBP01222 138 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 S100A2P29034 98 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 AMTP48728 403 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01620Q4KN68 170 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.09□□□□□ -1.27
TOP3A-210ENST00000580713 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 LECT2O14960 151 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 HBDP02042 147 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 WFDC2Q14508 124 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 PMCHL1Q16048 86 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TM2D2Q9BX73 214 aa7.08□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 G0S2P27469 103 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM18Q96B42 140 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.07□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 A0A096LNJ9 63 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-30P01768 117 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-33P01772 117 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 FABP4P15090 132 aa7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.06□□□□□ -1.28
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