RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 TPRKBQ9Y3C4 175 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2L6O14933 153 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 FGF7P21781 194 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM8Q96KF7 97 aa2.28□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 B4DEV8 164 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 NUPR1O60356 82 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 OR7C2O60412 319 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SLC25A6P12236 298 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 RPL12P30050 165 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 GABARAPL2P60520 117 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 PRNTQ86SH4 94 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM229BQ8NBD8 167 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 CMTM2Q8TAZ6 248 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 MTFP1Q9UDX5 166 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 FLVCR2Q9UPI3 526 aa2.27□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 BCE1O60756 84 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 HPGDSO60760 199 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 CST7O76096 145 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 BAXQ07812 192 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SMUG1Q53HV7 270 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 NDFIP1Q9BT67 221 aa2.26□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 DISC1C4P0D8 188 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 KRBOX1C9JBD0 128 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 ESDP10768 282 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SPRR2EP22531 72 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SPRR2BP35325 72 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SPRR2AP35326 72 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SEC61GP60059 68 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SPANXN2Q5MJ10 180 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 ZFP82Q8N141 532 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 GGACTQ9BVM4 153 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 OTORQ9NRC9 128 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 NUDT15Q9NV35 164 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 C22orf24Q9Y442 160 aa2.25□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GWB2 263 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 C7orf66A4D0T2 115 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 CRIP1P50238 77 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SPAG11BQ08648 103 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZVH6 145 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 C5orf38Q86SI9 138 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 MTURNQ8N3F0 131 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 PACRGLQ8N7B6 248 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00167Q96N53 147 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 IMMP2LQ96T52 175 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 MARVELD1Q9BSK0 173 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 UQCC1Q9NVA1 299 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.24□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 PCP4L1A6NKN8 68 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 FAM25AB3EWG3 89 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 FAM25CB3EWG5 89 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 FAM25GB3EWG6 89 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 M0QY20 66 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 ATP5LO75964 103 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 APOA1P02647 267 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 NTF3P20783 257 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2AP49459 152 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 TMBIM6P55061 237 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 PRLHP81277 87 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 DNLZQ5SXM8 178 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 UQCC3Q6UW78 93 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM252Q8N6L7 170 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 XKRY2A2RUG3 117 aa2.22□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 COX7A2LO14548 114 aa2.22□□□□□ -2.05
TMOD3-210ENST00000561408 SH2D1AO60880 128 aa2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms