RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561096.5

MEIS3-210, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,883 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-210ENST00000561096 MIFP14174 115 aa11.54□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 CRYBA4P53673 196 aa11.54□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 VAMP3Q15836 100 aa11.54□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.54□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.54□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 AMELXQ99217 191 aa11.54□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 NFE4Q86UQ8 179 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-210ENST00000561096 DNHD1Q96M86 4753 aa11.52□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 VCX2Q9H322 139 aa11.52□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 TENM3Q9P273 2699 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 DEFB4AO15263 64 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 SIVA1O15304 175 aa11.5□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.5□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 E9PLD3 99 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 SEC11AP67812 179 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 Q6ZUT4 128 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 CELA1Q9UNI1 258 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.48□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.47□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 PRO0255Q9UI72 69 aa11.47□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 A0A0J9YXV3 536 aa11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-210ENST00000561096 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.46□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 DAD1P61803 113 aa11.46□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TMEM243Q9BU79 118 aa11.46□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 HIGD1BQ9P298 99 aa11.46□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 HERVK_113P61574 105 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 RETNQ9HD89 108 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 GYPEP15421 78 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 H7C423 109 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TMEM223A0PJW6 202 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 K7EIL1 84 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 K7ERU9 68 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 ATP5G1P05496 136 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 UBE2D1P51668 147 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 HSD52Q0P140 79 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 PAX4O43316 350 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 H3BRM9 83 aa11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 UBE2L6O14933 153 aa11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 RNF151Q2KHN1 245 aa11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 A6NDN8 102 aa11.4□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.4□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.4□□□□□ -0.58
MEIS3-210ENST00000561096 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.4□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa11.4□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.4□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 VPS25Q9BRG1 176 aa11.4□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 C9orf118A6NHY6 69 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 ZNF815PA8K554 130 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 LEPROTO15243 131 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 TIRAPP58753 221 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 TMEM101Q96IK0 257 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 A0A0J9YY99 117 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 GAGE10A6NGK3 116 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 J3QQQ9 107 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 GAGE6Q13070 117 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 F5H768 121 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 C12orf74Q32Q52 190 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 K7EP34 96 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 TAL2Q16559 108 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 A0A096LPF7 62 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-210ENST00000561096 HERVK_113P63121 156 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms