RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DAPK1P53355 1430 aa-0.55□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DOCK2Q92608 1830 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 E5RI56 91 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 APOC3P02656 99 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 IL5P05113 134 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SCTP09683 121 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CCL8P80075 99 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 BAGE2Q86Y30 109 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 USMG5Q96IX5 58 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 AQP10Q96PS8 301 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SEC11CQ9BY50 192 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 V9GYH0 126 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MUC17Q685J3 4493 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.56□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GV72 72 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM238C9JI98 176 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 UQCR11O14957 56 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFB6O95139 128 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TNFSF15O95150 251 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 S100A5P33763 92 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TPPP2P59282 170 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 C10orf128Q5T292 105 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TAC4Q86UU9 113 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 LYSTQ99698 3801 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SPANXCQ9NY87 97 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MRC1P22897 1456 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.57□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PKD1P98161 4303 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PXDNQ92626 1479 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 F8VRH5 84 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 H0YGG7 62 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ARPC5O15511 151 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PITX3O75364 302 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SIX6O95475 246 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 G0S2P27469 103 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 V9GYQ6 96 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 MTORP42345 2549 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.58□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CEP290O15078 2479 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1B0GX51 115 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TSTD3H0UI37 97 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 J3QR89 54 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 M0R129 80 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SSSCA1O60232 199 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DBIP07108 87 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 GNG10P50151 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 B2MP61769 119 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC153Q494R4 210 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 Q6AWC8 147 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 Q6ZUT4 128 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TTC9CQ8N5M4 171 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 CENPHQ9H3R5 247 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 PATJQ8NI35 1801 aa-0.59□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 REV3LO60673 3130 aa-0.6□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 FAM186AA6NE01 2351 aa-0.6□□□□□ -2.5
FAM227B-211ENST00000560557 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 FMN2Q9NZ56 1722 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 SYNJ1O43426 1573 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 MYOM3Q5VTT5 1437 aa-0.6□□□□□ -2.51
FAM227B-211ENST00000560557 HCG22E2RYF7 251 aa-0.6□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms