RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.66□□□□□ -0.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.65□□□□□ -0.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HLA-DQA1P01909 254 aa12.65□□□□□ -0.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.65□□□□□ -0.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SVBPQ8N300 66 aa12.65□□□□□ -0.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa12.65□□□□□ -0.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPBPP02775 128 aa12.64□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CKS2P33552 79 aa12.64□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.64□□□□□ -0.39
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFA5Q16718 116 aa12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM101Q96IK0 257 aa12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf78Q9BR46 151 aa12.63□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VCYO14598 125 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHOX2AO14813 284 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNFRSF6BO95407 300 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSHBP01222 138 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ESDP10768 282 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FCER1GP30273 86 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMAGPQ0VAQ4 97 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.62□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.61□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OXTP01178 125 aa12.61□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIR2DL4Q99706 377 aa12.61□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa12.61□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPYP01303 97 aa12.6□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 S100PP25815 95 aa12.6□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ORMDL3Q8N138 153 aa12.6□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCAPO15273 167 aa12.59□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGF6P10767 208 aa12.59□□□□□ -0.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa12.58□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRSS47A8MTI9 375 aa12.58□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP17L23D6RBM5 183 aa12.58□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR5A1Q8NGJ0 315 aa12.58□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.58□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBR4Q5T4S7 5183 aa12.57□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRELID3AQ96N28 172 aa12.57□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.57□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.57□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.56□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.56□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM18Q96B42 140 aa12.56□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YPEL4Q96NS1 127 aa12.55□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COX19Q49B96 90 aa12.54□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP161Q6P656 301 aa12.54□□□□□ -0.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.52□□□□□ -0.41
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FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.52□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MT-ND6P03923 174 aa12.51□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRSS1P07477 247 aa12.51□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.51□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 hDV102S1A0JD36 115 aa12.5□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.5□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SS18Q15532 418 aa12.5□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C9orf163Q8N9P6 203 aa12.5□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.49□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.49□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP1LC3AQ9H492 121 aa12.49□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB5AP20339 215 aa12.48□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q8N8P6 123 aa12.48□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMM21Q9BVV7 248 aa12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa12.47□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa12.46□□□□□ -0.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL25O15444 150 aa12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XCL1P47992 114 aa12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM104AQ969W3 186 aa12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMCO4Q9NRQ5 59 aa12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 K7EMI3 77 aa12.44□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.44□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf196B1AJZ1 125 aa12.43□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNBPP62633 177 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FABP9Q0Z7S8 132 aa12.43□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.43□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC01546A6NGU7 62 aa12.42□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.42□□□□□ -0.42
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