RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 FGF6P10767 208 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 K7EMI3 77 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CS-224ENST00000551155 C16orf90A8MZG2 172 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.21□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 DNAH2Q9P225 4427 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 G0S2P27469 103 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 C14orf177Q52M58 125 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 Q8N814 137 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 Q8N8P6 123 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 CCL25O15444 150 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 BAALCQ8WXS3 180 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-2P60368 255 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 SS18Q15532 418 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.18□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 LECT2O14960 151 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 LINC01549A6NIU2 74 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 CFAP161Q6P656 301 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 USP17L23D6RBM5 183 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 NPSP0C0P6 89 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 GCSHP23434 173 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 WFDC2Q14508 124 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 YPEL4Q96NS1 127 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-224ENST00000551155 PKD1P98161 4303 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.15□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 XCL1P47992 114 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 Q6ZN92 141 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 Q6ZUT4 128 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 FA2HQ7L5A8 372 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 TMEM141Q96I45 108 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 LINC01546A6NGU7 62 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 RAB5BP61020 215 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 hDV102S1A0JD36 115 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 IFITM10A6NMD0 228 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 CDK2AP2O75956 126 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 LINC00614P0C842 121 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 FOXI1Q12951 378 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 TOMM6Q96B49 74 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 VCX2Q9H322 139 aa6.12□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-224ENST00000551155 IGIPA6NJ69 53 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105 ms