RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CS-217ENST00000550044 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 RBX1P62877 108 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 COTL1Q14019 142 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 ENHOQ6UWT2 76 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TMEM243Q9BU79 118 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TM2D2Q9BX73 214 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TMEM218A2RU14 115 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 F8W036 122 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 LECT2O14960 151 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 NCR2O95944 276 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 PMCHP20382 165 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 AMTP48728 403 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 UQCC3Q6UW78 93 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 COMMD7Q86VX2 200 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 ST20Q9HBF5 79 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 I3L3M4 83 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 UBE2L6O14933 153 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 PPP1R2P9O14990 202 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 MT-ND4LP03901 98 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 ADCYAP1P18509 176 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 PKIAP61925 76 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 Q0VG73 95 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 BAALCQ8WXS3 180 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 MRAP2Q96G30 205 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 CRPP02741 224 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 HBBP68871 147 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 HAMPP81172 84 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 WFDC2Q14508 124 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 RMI2Q96E14 147 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GW15 77 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GXF2 115 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 APCSP02743 223 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 CKS2P33552 79 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 Q8N814 137 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 NRACQ8N912 160 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 COX11Q9Y6N1 276 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 RNF213Q63HN8 5207 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GUV1 79 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 LINC00862A6NCI5 91 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 TSHBP01222 138 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 S100A8P05109 93 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-1P60331 282 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 REG3AQ06141 175 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 SEC11CQ9BY50 192 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 PRR34Q9NV39 138 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-217ENST00000550044 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 D6R8Y8 96 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 PPP1R17O96001 155 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 HLA-DQA1P01909 254 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 MIAQ16674 131 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 FGF6P10767 208 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 ESDP10768 282 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 FCER1GP30273 86 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 F8WDY8 70 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 H7C423 109 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 NPYP01303 97 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 UBE2V1Q13404 147 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 TMEM18Q96B42 140 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 BTF3L4Q96K17 158 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 KIR2DL4Q99706 377 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 C20orf78Q9BR46 151 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 PPBPP02775 128 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 GAGE2BQ13066 116 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 GAGE2EQ4V326 116 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-217ENST00000550044 ORMDL3Q8N138 153 aa6.3□□□□□ -1.4
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