RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545392.1

TBK1-208, Transcript of TANK binding kinase 1, human

TSL 3

Gene TBK1, Length 408 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBK1-208	ENST00000545392	NCS1	P62166	190 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	CCL8	P80075	99 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	COX17	Q14061	63 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	REV3L	O60673	3130 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TRANK1	O15050	2925 aa		-1.04	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	DAPK1	P53355	1430 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	GNG10	P50151	68 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	AMELX	Q99217	191 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SAR1A	Q9NR31	198 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		V9GYH0	126 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	PXDN	Q92626	1479 aa		-1.05	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SNCG	O76070	127 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	NCR2	O95944	276 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	COX8A	P10176	69 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	S100G	P29377	79 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	C10orf128	Q5T292	105 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	BAGE2	Q86Y30	109 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SEC11C	Q9BY50	192 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SBF2	Q86WG5	1849 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	ZFHX3	Q15911	3703 aa		-1.06	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		A0A1B0GV72	72 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		A0A1B0GX51	115 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		E5RI56	91 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SIX6	O95475	246 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	IFNG	P01579	166 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	MT1A	P04731	61 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		Q6AWC8	147 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		Q6ZUT4	128 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SPTSSA	Q969W0	71 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		-1.07	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	HMGXB3	Q12766	1538 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	RYR2	Q92736	4967 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	HCG22	E2RYF7	251 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392		F8VRH5	84 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	UQCR11	O14957	56 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	NDUFB6	O95139	128 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	APOC3	P02656	99 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	AQP10	Q96PS8	301 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SMPX	Q9UHP9	88 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		-1.08	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	NAA60	Q9H7X0	242 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	KIAA0556	O60303	1618 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	MYH6	P13533	1939 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		-1.09	□□□□□ -2.58
TBK1-208	ENST00000545392	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	IFT140	Q96RY7	1462 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	ARPC5	O15511	151 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	E2F6	O75461	281 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	IGLC6	P0CF74	106 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	TPPP2	P59282	170 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	USMG5	Q96IX5	58 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	LRRK2	Q5S007	2527 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	ADGRB1	O14514	1584 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		-1.1	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		-1.11	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		-1.11	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	ALX1	Q15699	326 aa		-1.11	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	CCDC153	Q494R4	210 aa		-1.11	□□□□□ -2.59
TBK1-208	ENST00000545392	TAC4	Q86UU9	113 aa		-1.11	□□□□□ -2.59

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