RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 XP32Q5T750 250 aa5.9□□□□□ -1.46
KDM5A-211ENST00000544777 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.9□□□□□ -1.46
KDM5A-211ENST00000544777 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.9□□□□□ -1.46
KDM5A-211ENST00000544777 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 G3V3Q6 166 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 IGLC6P0CF74 106 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 SPAG11BQ08648 103 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.89□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 TSHBP01222 138 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 GAGE2EQ4V326 116 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 GATD1Q8NB37 220 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.88□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 F2Z2F3 143 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 PMCHP20382 165 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 DEFA1P59665 94 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 C5orf38Q86SI9 138 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.87□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 F8WDY8 70 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 I3L3M4 83 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 NDUFA1O15239 70 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 SSNA1O43805 119 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 NUPR1O60356 82 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 CFC1BP0CG36 223 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 ENKURQ8TC29 256 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 MRAP2Q96G30 205 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 ALG5Q9Y673 324 aa5.86□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 XKRY2A2RUG3 117 aa5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 PAGE4O60829 102 aa5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.85□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 CTAG1AP78358 180 aa5.84□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.84□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.84□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.84□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.84□□□□□ -1.47
KDM5A-211ENST00000544777 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 PFDN1O60925 122 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 IFNA1P01562 189 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TWIST1Q15672 202 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 C10orf25Q5T742 122 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TEX261Q6UWH6 196 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TMUB2Q71RG4 321 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.83□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 FAM210AQ96ND0 272 aa5.82□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.82□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.82□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.81□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.81□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.8□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.8□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.8□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.8□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 CTRLP40313 264 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 MT1HP80294 61 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 ST20Q9HBF5 79 aa5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 BCE1O60756 84 aa5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 LINC00242Q5T6M2 205 aa5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 CNFNQ9BYD5 112 aa5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 C22orf24Q9Y442 160 aa5.78□□□□□ -1.48
KDM5A-211ENST00000544777 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.77□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 A0A1B0GV50 99 aa5.77□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 CENPWQ5EE01 88 aa5.77□□□□□ -1.49
KDM5A-211ENST00000544777 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms