RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 SIGMAR1Q99720 223 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 TRACP01848 142 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N2B8 174 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 PTPRBP23467 1997 aa7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 RPL39P62891 51 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 BAALCQ8WXS3 180 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV2-8P01709 118 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 CITED1Q99966 193 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 MPV17L2Q567V2 206 aa7.55□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 ATRQ13535 2644 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 TOMM6Q96B49 74 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.54□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 H0YGX0 51 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 COX7BP24311 80 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 KLLNB2CW77 178 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 UBE2D2P62837 147 aa7.53□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 IGLC6P0CF74 106 aa7.52□□□□□ -1.2
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZVH6 145 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01545Q5VT33 79 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 C6orf223Q8N319 242 aa7.52□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZUT4 128 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 H0Y9J4 135 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 K7EP13 123 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 KIR3DS1Q14943 382 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.51□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 USP24Q9UPU5 2620 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 PLXNB1O43157 2135 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV2-11P01706 119 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 MLST8Q9BVC4 326 aa7.5□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 COX8AP10176 69 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 C9JAW5 83 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 TCL1BO95988 128 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.49□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 M0QY20 66 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.48□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 C11orf86A6NJI1 115 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 DLEU1O43261 78 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 REG3GQ6UW15 175 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 EDN2P20800 178 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 NREPQ16612 68 aa7.46□□□□□ -1.21
POLR1B-217ENST00000541869 USP17L23D6RBM5 183 aa7.46□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 FOXI1Q12951 378 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 PCP2Q8IVA1 136 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 CEND1Q8N111 149 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 A4D1N5 150 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 CENPFP49454 3210 aa7.45□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf137Q5JT78 98 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.44□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 CFC1BP0CG36 223 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 CFC1P0CG37 223 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 PRR9Q5T870 116 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 M0QXV9 152 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 CRIP1P50238 77 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 PYY3Q5JQD4 70 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GXF2 115 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 E9PLD3 99 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 PRM2P04554 102 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.42□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 IGKV2D-28P01615 120 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 XGP55808 180 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms